文献知网节
中国畜牧兽医. 2015, 42 (04) 北大核心

山羊皮肤新microRNA的挖掘

刘志红赵濛于梦然奈日乐王志新肖红梅赵艳红李金泉

  内蒙古农业大学动物科学学院  

摘要：已有证据表明,microRNA在动物皮毛发育和形态发生过程中发挥重要的作用。在山羊皮肤microRNA的研究中,数据库不完善仍是限制其功能研究的主要原因。本研究以山羊基因组为参考,对高通量测序中未注释的占总reads 5.40%的数据,使用Mireap软件预测的方法进行数据挖掘,并对新的microRNA的长度、表达量、基因组定位、靶基因预测及KEGG pathway进行分析。研究预测到28个新的microRNA,其长度分布与已知山羊、牛等动物的分布一致。对表达量统计表明,表达量在100以上的有4个,最高的是Novel-15,达到555;表达量在10~100的有19个;低于10的有5个。基因组定位研究表明,新microRNA在山羊染色体上分布均匀,在5、6、7、19和X染色体上分别有两个microRNA被定位。预测和分析得到6 519个靶基因。KEGG分析结果表明,有3 552个靶基因定位到51条通路中,占前3位的通路是Metabolic pathways、Pathways in cancer、MAPK signaling pathway。本研究发掘了更多山羊的microRNA,为今后山... 更多
关键词：

山羊; microRNA; 皮肤; MAPK;

  • DOI：

    10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.04.001

  • 专辑：

    农业科技; 理工A(数学物理力学天地生)

  • 专题：

    生物学; 畜牧与动物医学

  • 分类号：

    S827;Q522

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