文献知网节
中华中医药学刊. 2019, 37 (12) 北大核心

基于生物信息学分析肝癌组织中关键基因及MicroRNA

吴娜毛祥坤万治平李瀚旻

  江西中医药大学附属医院    南昌市洪都中医院    湖北省中医院湖北中医药大学附属医院湖北省中医药研究院  

摘要：目的:探讨肝细胞癌中关键基因、miRNA及相关的信号通路。方法:在美国国立生物技术信息中心数据库GEO（Gene Expression Omnibus）中下载4个芯片数据（GSE62232、GSE84598及GSE452673个基因数据及GSE98269miRNA数据）进行分析。将筛选出的差异基因（differentially expressed genes,DEGs）输入DAVID数据库进行Gene ontology（GO）及Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）富集分析,用Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作分析图。将筛选出的差异miRNA（differentially expressed miRNAs,DEMs）用在线软件miRDB进行靶基因预测。结果:通过筛选后发现152个DEGs（103个下调基因及49个上调基因）及34个DEMs（26个DEMs高表达,8个DEMs低表达）。经过DAVID分析后发现P53信号通路、卵母细胞减数分裂等生物过程参与肝癌的发生发展。结论:在152个DEGs中TOP2A、AURKA、HMMR、A... 更多
关键词：

肝癌; 生信分析; DEGs; DEMs; 信号通路;

  • DOI：

    10.13193/j.issn.1673-7717.2019.12.014

  • 专辑：

    医药卫生科技; 理工A(数学物理力学天地生)

  • 专题：

    生物学; 肿瘤学

  • 分类号：

    R735.7;Q811.4

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